Futbol hayatına babasının desteğiyle 1990'da Zeytinburnuspor'da başlayan Emre, artık tüm dünyanın tanıdığı ve her büyük kulübün kadrosuna katmak istediği bir futbolcu.
Emre 1995'te Galatasaray'a transfer oldu ve Fatih Terim'in disiplini, Hagi ve Okan Buruk'un yardımlarıyla hem defansif, hem de ofansif yönü güçlü, pas yapabilen bir oyuncu haline geldi. Galatasaray'ın 4 sene üstüste kazandığı şampiyonluklarda büyük rol oynayan Emre, 2000'de kazanılan UEFA şampiyonluğu'nda da önemli pay sahibiydi.
Daha çocukken dahi Emre'nin aklı Avrupa'daydı. Fırsatını bulur bulmaz da İtalyan devi Inter'e transfer oldu. Bu takımda zaman zaman başarılı maçlar çıkarsa da, gerek sakatlıklar, gerekse takımdaki diğer yıldızlar yüzünden yedek kaldı.
2002'de dünya üçüncüsü olan milli takımın en önemli oyuncularından biri olan Emre, şimdilerde kendine yer bulabileceği bir takım arıyor. Özellikle İngiliz kulüplerinin ilgisini çekse de, Fenerbahçe'nin de devrede olduğu bilinen bir gerçek. Emre'nin Türkiye'ye dönüp dönmeyeceği merakla bekleniyor.